A organização dos Sábados Mensais de Animação Pedagógica fica a cargo da Comissão Coordenadora de cada Núcleo Regional. Podem organizar-se sob as formas de:
– Jornadas pedagógicas (temáticas);
– Apresentação simultânea de três relatos de práticas (pré-escolar, 1º ciclo e 2º/3º ciclos, secundário e superior), seguidos de debate;
– Sessões plenárias, com apresentação e discussão de um trabalho académico ou um tema de atualidade na política educativa.
Em setembro, em alguns dos Núcleos Regionais, as Comissões Coordenadoras promovem a realização de Jornadas Pedagógicas que correspondem a pequenos congressos regionais de apoio ao início do ano escolar.